داستان ۳۰ سال بعد از ظهور موجودات مهاجم بیگانه اتفاق می‌افتد؛ موجوداتی که دنیا را تا مرز نابودی برده‌اند. انسان‌ها هنوز برای بقا با این تهدیدها می‌جنگند و سازمانی به نام EXCEEDS برای مقابله با خطرات آن‌ها فعالیت می‌کند. ماجرا از کشور جزیره‌ای میزوهـو شروع می‌شود، جایی که شینا کوزه، شکارچی جوان موجودات مهاجم، فقط می‌خواهد با خواهر کوچکش ستسونا زندگی آرامی داشته باشد؛ اما یک حادثه او را وارد درگیری بزرگ‌تری می‌کند.